W realizacji zadań Biuro współpracuje ze wszystkimi wydziałami Urzędu, jednostkami organizacyjnymi Miasta oraz z gminami gdańskiego obszaru metropolitarnego, a w szczególności:

• w zakresie opracowywania koncepcji i wdrażania rozwiązań informatycznych usprawniających realizację zadań merytorycznych;
• w zakresie wyznaczania dla rozwiązań informatycznych: standardów, założeń architektonicznych;
• w zakresie opracowywania i wdrażania spójnych polityk bezpieczeństwa informacji;
• z jednostkami organizacyjnymi Miasta w zakresie uzyskiwania, utrzymywania i integracji zasobów miejskich infrastruktury informatycznej;
• z organizacjami aktywnymi w obszarze rozwoju społeczeństwa informacyjnego, w szczególności w celu aktywizacji postaw obywatelskich mieszkańców Gdańska;
• z Gdańskim Centrum Informatycznym w zakresie świadczonych usług informatycznych;
• z Wydziałem Kadr i Organizacji, Wydziałem Spraw Obywatelskich i Biurem Rady Miasta Gdańska w zakresie obsługi informatycznej wyborów;
• z Wydziałem Infrastruktury w zakresie ewidencji sprzętu komputerowego, informatycznego oprzyrządowania strukturalnego i przyłączy światłowodowych.

Biuro wykonuje zadania związane z nadzorem nad działalnością Gdańskiego Centrum Informatycznego.