W realizacji zadań Wydział współpracuje ze wszystkimi wydziałami Urzędu oraz z gminami obszaru metropolitalnego, a w szczególności z:
- Wydziałem Geodezji w zakresie określania stanu prawnego nieruchomości
- Biurem Rozwoju Gdańska w zakresie miejscowych planów zagospodarowania przestrzennego
- Biurem Architekta Miasta w zakresie rozwoju urbanistyczno-architektonicznego Miasta
- Wydziałem Projektów Inwestycyjnych w zakresie planowania inwestycji oraz realizowania projektów finansowanych z funduszy zewnętrznych
- Wydziałem Budżetu Miasta i Podatków w zakresie planowania i wykonywania budżetu
- Wydziałem Ekologii i Energetyki w zakresie uzgadniania projektów decyzji o warunkach zabudowy i zagospodarowania terenu oraz projektów budowlanych inwestycji
- Wydziałem Skarbu w zakresie prawa do dysponowania na cele budowlane gruntami na terenach komunalnych, wydawania dokumentów i opinii w sprawie zasadności nabywania przez cudzoziemców nieruchomości oraz regulowania stanów prawnych nieruchomości;
- Wydziałem Gospodarki Komunalnej w zakresie inicjowania i realizacji działań prowadzących do wypełnienia przez Miasto postanowień Gdańskiej Karty Mobilności Aktywnej, wydawania opinii urbanistycznych dotyczących lokalizacji targowisk, informacji sieciowej, gospodarowania odpadami komunalnymi oraz poprawy dostępności dla osób ze szczególnymi potrzebami;
- Wydziałem Mieszkalnictwa w zakresie opiniowania rozwiązań projektowanych przekształceń i modernizacji obiektów komunalnych, adaptacji części nieruchomości wspólnej oraz zmiany przeznaczenia lokali i części nieruchomości wspólnej;
- Wydziałami Skarbu i Geodezji w zakresie ustalania sprzedanych nieruchomości, których wartość wzrosła na skutek uchwalenia lub zmiany miejscowego planu zagospodarowania przestrzennego
- Wydziałem Polityki Gospodarczej w zakresie obsługi inwestora i przedsiębiorcy
- Wydziałami Gospodarki Komunalnej, Mieszkalnictwa, Rozwoju Społecznego, Edukacji, Polityki Gospodarczej, Bezpieczeństwa i Zarządzania Kryzysowego, Biurem Rozwoju Gdańska, Miejskim Ośrodkiem Pomocy Rodzinie, w zakresie opracowywania wieloaspektowych analiz o stanie Miasta pod kątem identyfikacji zjawisk kryzysowych i ich przyczyn
- Gdańskim Zarządem Dróg i Zieleni w zakresie opiniowania rozwiązań projektowanej infrastruktury technicznej i drogowej oraz zagospodarowania przestrzeni publicznej
- Dyrekcją Rozbudowy Miasta Gdańska w zakresie zagospodarowania przestrzeni publicznej
- Wydziałem Finansowym w zakresie realizacji dochodów i wydatków Urzędu
- Wydziałem Projektów Inwestycyjnych i Dyrekcją Rozbudowy Miasta Gdańska w zakresie zgodności inwestycji z zapisami miejscowego planu zagospodarowania przestrzennego
- Biurem Inżyniera Miasta w zakresie projektowanych rozwiązań organizacji ruchu na drogach.