W realizacji zadań Biuro współpracuje ze wszystkimi wydziałami Urzędu, jednostkami organizacyjnymi Miasta oraz z gminami obszaru metropolitalnego, a w szczególności z:
- Biurem Rozwoju Gdańska w zakresie sporządzania Studium uwarunkowań i kierunków zagospodarowania przestrzennego, miejscowych planów zagospodarowania przestrzennego, rewitalizacji oraz innych opracowań urbanistycznych, w tym udziału w spotkaniach roboczych;
- Wydziałem Skarbu, Gdańskimi Nieruchomościami oraz Dyrekcją Rozbudowy Miasta Gdańska w zakresie przygotowywania ofert inwestycyjnych, uwzględniających wymóg złożenia koncepcji architektonicznej oraz podlegających ocenie przy sprzedaży atrakcyjnych terenów Miasta;
- Wydziałem Polityki Gospodarczej w zakresie wypracowywania i negocjowania wymagań architektonicznych i przestrzennych dla strategicznych w przestrzeni Miasta inwestycji planowanych lub realizowanych przez inwestorów prywatnych (partnerstwa publiczno - prywatnego);
- Wydziałem Urbanistyki i Architektury w zakresie ustalania warunków zabudowy i zagospodarowania terenu oraz wydawania pozwolenia na budowę;
- Gdańskim Zarządem Dróg i Zieleni w zakresie estetyki obiektów i przestrzeni miejskich;
- merytorycznymi wydziałami i jednostkami organizacyjnymi Miasta w zakresie rozwiązywania problemów urbanistyczno-architektonicznych dla wyznaczonych obszarów;
- wszystkimi wydziałami Urzędu i jednostkami organizacyjnymi Miasta zlecającymi sporządzanie uwarunkowań architektonicznych dla projektów dotyczących inwestycji miejskich;
- współpraca z organami administracji rządowej, samorządowej, organizacjami społecznymi oraz instytucjami ochrony dóbr kultury w zakresie ochrony zabytków.